C28H19P
386.42
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C28H19P
386.42
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特点:
•可以检测基因组DNA样品的碱基位点数量
•采用方便的比色法检测
•检测范围:40个碱基位点/ 1×105 碱基对DNA
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DNA损伤丨从实验思路到检测指标 PDF下载
指标 | 关联指标干货参考(点击查看) | 检测指标(点击查看) |
DNA损伤检测 |
γ-H2AX | DNA损伤检测试剂盒- γH2AX(绿、红、深红) |
AP位点 | DNA损伤检测试剂盒(AP位点法) | |
核小体 | Nucleolus Bright (绿、红) | |
细胞周期 | Cell Cycle Assay Kit – PI/RNase Staining | |
DNA损伤关联指标 | 氧化损伤 | DMPO |
BMPO | ||
TEMP | ||
SOD Assay Kit | ||
DPPH Antioxidant Assay Kit | ||
凋亡 | Annexin V, FITC Apoptosis Detection Kit/PI | |
Annexin V, 633 Apoptosis Detection Kit/PI | ||
Cell Cycle Assay Solution Deep Red/Blue | ||
JC-1 MitoMP Detection Kit | ||
Caspase-3 Assay Kit | ||
铁死亡 | Lipid Peroxidation Probe -BDP 581/591 C11 | |
Liperfluo | ||
GSSG/GSH Quantification Kit II | ||
Iron Assay Kit | ||
Mito-FerroGreen | ||
衰老 | Cellular Senescence Detection Kit – SPiDER-βGal | |
Cellular Senescence Plate Assay Kit – SPiDER-βGal | ||
SPiDER-βGal | ||
自噬 | Mitophagy Detection Kit | |
DALGreen – Autophagy Detection | ||
DAPGreen – Autophagy Detection | ||
DAPRed – Autophagy Detection |
*点击即可跳转至详情页
试剂盒内含
产品概述
DNA的氧化损伤是由于DNA与活性氧 (ROS) 尤其是羟自由基之间的相互作用造成的。由超氧阴离子和过氧化氢通过Fenton反应产生的羟自由基在DNA中产生多重修饰。羟自由基对脱氧核糖基团的氧化攻击将导致DNA释放自由碱基,产生链断裂、各种糖修饰以及单个无碱基位点 (AP位点) 。事实上AP位点是由ROS产生的损伤的主要类型。醛反应性探针 (ARP;N’-氨氧基甲基羰基肼-D-生物素) 特异性地与AP位点的开环上的醛基反应。通过这个反应可以检测到导致醛基形成的DNA修饰。用过量ARP试剂反应后,DNA上的所有AP位点均用生物素做了标签。可以用亲和素-生物素法,用连接到亲和素上的过氧化物酶或碱性磷酸酶做比色法检测来对这些带有生物素标签的AP位点进行计数。DNA损伤定量试剂盒包含用于检测每1×105个碱基对中1-40个AP位点的所有必需溶液。
*本试剂盒仅适用于基因组DNA中无碱基位点 (Abasic Sites)的检测。
原理
DNA损伤在除了复制过程中的DNA聚合酶错误外,保留有机体遗传信息的DNA在体内还受到环境辐射,紫外线,化学物质(如烷基化剂)和代谢物(如活性氧)的破坏,接收。如果这些错误和伤害得不到适当的修复,它们将导致突变,从而导致癌症和衰老。
DNA损伤部位有修复结构,其中之一就是去除碱修复。此时,将出现一个称为AP位点的基础位点(apurinic/apyrimidinic位点)。换句话说,AP位点的检测是可以测量DNA损伤位点的有效方法。
ARP(N’-氨基氧基甲基羰基肼基-D-生物素)是已知可以与该AP位点进行生物素特异结合的试剂。-Nucleostain-DNA Damage Quantification Kit-AP Site Counting-是一种可以通过使用ARP将DNA生物素化并固定在96孔微板上,可以简单地定量样品DNA中的AP 位点的试剂盒。
该试剂盒包含具有与AP位点的标准DNA,并且可以使用HRP标记的链霉亲和素通过生物素检测方法对AP位点进行定量。
使用方法请看实验例。
*冷藏保存中或恢复到室温时,有时会在管状管中看到水滴状的液粒。
这是由干燥防止剂液粒化而成的,产品的性能没有问题。
*本套装中含有加入了溶液的试剂组件。
溶液可能会粘附在试管或瓶盖的内壁上,因此在打开前应先摇匀
技术信息
除试剂盒以外必要的物品
・10μl,200μl,1 ml微量移液器(可变型)
・200μl多通道移液器(可变型)
・培养箱(37℃)
・酶标仪
・0.5 ml,1.5 ml离心管
・离心机
・DNA纯化试剂盒
・纸巾
本公司出售各种DNA纯化试剂盒。
Get pureDNA Kit-Cell, Tissue(Code:GK03)
关于DNA提纯的问题,请咨询同仁化学。
操作方法
常见问题Q&A
Q1: 是否可以创建40个以上AP位点/ 100,000个标准溶液? |
A1:该试剂盒的标准DNA是0-40个AP位点/ 100,000ARP-DNA。但我们已经准备了多达50个AP站点/ 100,000个的ARP-DNA(暂时没有做到更多)。从理论上讲,可以制备更多的ARP-DNA,但这么做的话我们无法保证和保持校准线的线性程度。
如果要检测更高浓度的碱基损伤,但样品DNA没有相同浓度的损伤,您可以用0AP 位点-DNA(测定范围内稀释)后再进行测定,之后再换算实际AP数比较好。 |
Q2: AP位点是DNA的一个基本损伤位点,被用作氧化应激的指标,除了AP位点之外,还有其他氧化应激指标吗? |
A2:我们创建了一个文档,概述了氧化应激的各种标记物。
从实验者的角度,描述了每种氧化应激标记的特性和检测样品的处理方法,因此请参考以下文档(日文)。 https://www.dojindo.co.jp/technical/beginner/stressmarker.pdf |
Q3:建议在DNA的纯度为吸光度为1.8以上进行检测。是否能够测量至1.5? |
A3:因为吸光度在1.5内没有做过类似实验,所以暂时无法确认。
我们用吸光度为1.6~1.7的DNA进行检测,但不能看到很大的变化。 所以推荐1.8或更高。 纯度低的话可能意味着蛋白质污染。低纯度蛋白质具有阻断作用,可能使DNA粘附在板上。 请使用尽可能高的纯度,因为它可能会阻止这种情况 |
Q4:是否可以存储提取的DNA而无需将其转换为ARP? |
A4:存储是不可取的,因为这会增加AP位点的数量。 (冷藏和冷冻)
如果要在不进行ARP化的情况下进行存储,请使用乙醇沉淀,制粒并冷冻保存。AP站点确实是容易发生剪切的部位。 但是,如果以catallist free的状态保存的话,即使在3’侧有断开也不会影响ARP的检测。 相反,如果提取的DNA储存在非冷冻状态的环境中, 由自然产生的去除碱形成的AP位点是一个更重要的问题。 所以在这种情况下,如果你的样品在正确存储标准DNA是可以进行修饰的。 ARP修饰后AP位点稳定,建议提取后迅速进行APR处理。 |
Q5:这个试剂盒可以检测什么? |
A5:您可以定量DNA中的AP位点。AP位点是[apurinic / appyrimidinic site]的缩写,作用于受损的DNA。一般在去除碱修复过程中会出现。DNA的损伤除了复制时DNA polymerase的错误之外,还受到紫外线,化学物质(如烷基化剂)和代谢物(如活性氧)的影响。
通过测定AP位点可以检测DNA损伤。 |
Q6:这个试剂盒能测定的样品数量是多少? |
A6:20samples为20个样品。
每个Filtration Tube都有20个samples。 因为一个样品一般使用一个Filtration Tube,所以这个Tube的数量即是可测定的样品数。 20samples的测定用的板也是1块板。 |
Q7:96孔板和过滤管中有溶液剩余,请告诉我废弃的方法 |
A7:多余的溶液请在确认以下成分信息后,按照政策规定的废弃规则废弃。
<配套试剂成分> ・ARP-DNA standard solution(稀释水后废弃,不含有害成分) ・ARP solution(稀释后作废,不含有害成分) ・DNA binding solution(稀释水后废弃,不含有害成分) ・Washing buffer(稀释水后废弃,不含有害成分) ・HRP-Striptavidin(稀释水后废弃,不含有害成分) ・TE buffer(可溶于水,EDA・2NA 0.1%以下) ・Substrate solution(稀释水后废弃,不含有害成分) |
参考文献
1) A. Sancar and G. B. Sancar, “DNA Repair Enzymes”, Annu. Rev. Biochem., 1988, 57, 29.
2) T. Lindahl and B. Nyberg, “Rate of Depurination of Native Deoxyribonucleic Acid”, Biochemistry, 1972, 11, 3610.
3) M. Liuzzi and M. Talpaert-Borle, “A New Approach to the Study of the Base-excision Repair Pathway Using Methoxyamine”, J. Biol. Chem., 1985, 260, 5252.
4) M. Weinfeld, M. Liuzzi and M. C. Paterson, “Response of Phage T4 Polynucleotide Kinase Toward Dinucleotides Containing Apurinic Sites: Design of a 32P-postlabeling Assay for Apurinic Sites in DNA”, Biochemistry, 1990, 29, 1737.
5) B. X. Chen, K. Kubo, H. Ide, B. F. Erlanger, S. S. Wallace and Y. W. Kow, “Properties of a Monoclonal Antibody for the Detection of Abasic Sites, a Common DNA Lesion”, Mutat. Res., 1992, 273, 253.
6) J. A. Gralnick and D. M. Downs, “The YggX Protein of Salmonella enterica Is Involoved in Fe(II) Trafficking and Minimizes the DNA Damage Cause by Hydroxyl Radicals:Residue CYS-7 is Essential for YggX Function”, J. Biol. Chem., 2003, 278, 20708.
7) J. W. Pippin, R. Durvasula, A. Petermann, K. Hiromura, W. G. Couser and S. J. Shankland, “DNA Damage is a Novel Response to Sublytic Complement C5b-9 Induced Injury in Podocytes”, J. Clin. Invest., 2003, 111, 877.
8) S. Watanabe, T. Ichimura, N. Fujita, S. Tsuruzono, I. Ohki, M. Shirakawa, M. Kawasuji and M. Nakao, “Methylated DNA-binding Domain 1 and Methylpurine DNA Glycosylase Link Transcriptional Repression and DNA Repair in Chromatin”, Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 2003, 100, 12859.
9) M. Endres, M. Ahmadi, I. Kruman, D. Biniszkiewicz, A. Meisel and K. Gertz, “Folate Deficiency Increases Postischemic Brain Injury”, Stroke, 2005, 36, 321.
10) J.-M. Li, M. Mogi, K. Tsukuda, H. Tomochika, J. Iwanami, L.-J. Min, C. Nahmias, M. Iwai and M. Horiuchi, “Angiotensin II-Induced Neural Differentiation via Angiotensin II Type 2 (AT2) Receptor-MMS2 Cascade Involving Interaction between AT2 Receptor-Interacting Protein and Src Homology 2 Domain-Containing Protein-Tyrosine Phosphatase 1”, Mol. Endocrinolo., 2007, 21(2):499.
11) D. R. McNeill and D. M. Wilson III, “A Dominant-Negative Form of the Major Human Abasic Endonuclease Enhances Cellular Sensitivity to Laboratory and Clinical DNA-Damaging Agents”, Mol. Cancer Res., 2007, 5(1), 61.
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特点:
● 细胞、组织样品均可检测
● 操作更加简单
● 采用荧光法灵敏度更高
产品概述
丙二醛(MDA)是脂质过氧化物分解后形成的一种化合物。因此,MDA 是检测细胞和组织中脂质过氧化物的最常见的指标之一,在氧化应激、铁死亡等领域的研究中被广泛使用。MDA Assay Kit 可以检测样品中的 MDA 浓度,通过硫代巴比妥酸(TBA)与水解产生的 MDA 反应形成的 TBA 复合体的吸光度或荧光强度来检测样品中的丙二醛(MDA)。试剂盒中配有抗氧化剂(Antioxidant),可以防止样品在反应过程中发生不必要的氧化,从而确保获得准确的实验结果。
试剂盒内含
测定原理
本试剂盒采用经典的TBA法,通过检测MDA/硫代巴比妥酸(TBA)复合体的荧光或吸光度来检测细胞或组织中的MDA浓度。此外,试剂盒中还附带MDA标准溶液,以便通过标准曲线检测样品中的MDA。
产品特点
简化操作步骤
一般的MDA检测试剂盒(TBA法),作为底物的硫代巴比妥酸(TBA)需要天平称量和高温加热溶解的步骤。而同仁化学研究所的MDA试剂盒中的TBA无需称量和加热溶解的操作,从而减少由于称量等造成的误差,使得实验结果的孔间差更小。同时,还可大幅缩短操作所需的时间。
细胞、组织样品均可检测
细胞样品通过荧光法检测。组织样品可以根据样品中MDA的含量在荧光法和吸光度法之间自由选择。具体可参考下表。
实验例
由于Erastin可以抑制xCT(胱氨酸/谷氨酸转运体),是最常见的铁死亡诱导剂之一。使用同仁化学研究所的MDA试剂盒检测Erastin处理的HepG2(人肝癌细胞)中MDA的变化。通过标准曲线(用BCA法蛋白定量校准后),计算样品中MDA的浓度。可以发现,Erastin处理的细胞中,MDA含量明显上升。
产品文献
1、K. Igarashi, H. Iwai, K. Tanaka, Y. Kuwahara, J. Kitanaka, N. Kitanaka, A. Kurimasa, K. Tomita, T. Sato, “Neuroprotective effect of oxytocin on cognitive dysfunction, DNA damage, and intracellular chloride disturbance in young mice after cranial irradiation”, 2022, Biochem. Biophys. Res. Commun., doi:10.1016/j.bbrc.2022.04.099.
2、J. Zhu, X. Wang, Y. Su, J. Shao, X. Song, W. Wang, L. Zhong, L. Gan, Y. Zhao, X. Dong, “Multifunctional nanolocks with GSH as the key for synergistic ferroptosis and anti-chemotherapeutic resistance”, 2022, doi:10.1016/j.biomaterials.2022.121704.
3、B. Yang, G. Joe, W. Li, Y. Shimizu, H. Saeki, “Comparison of Maillard-Type Glycated Collagen with Alginate Oligosaccharide and Glucose: Its Characterization, Antioxidant Activity, and Cytoprotective Activity on H2O2-Induced Cell Oxidative Damage”, 2022, doi:10.3390/foods11152374.
4、L. Dong, Z. Jiang, L. Yang, F. Hu, W. Zheng, P. Xue, S. Jiang, M. E. Andersen, G. He, M. J. C. Crabbe, W. Qu, “The genotoxic potential of mixed nitrosamines in drinking water involves oxidative stress and Nrf2 activation”, 2022, doi:10.1016/j.jhazmat.2021.128010.
5、C. Hou, L. Xiao, X. Ren, L. Cheng, B. Guo, M. Zhang, N. Yan., “EZH2-mediated H3K27me3 is a predictive biomarker and therapeutic target in uveal melanoma”, 2022, Front. Genet., doi:10.3389/fgene.2022.1013475.
6.Lizhong Yao, Junyi Hou, Xiongyan Wu, Yifan Lu, Zhijian Jin, Zhenjia Yu, Beiqin Yu, Jianfang Li, Zhongyin Yang, Chen Li, Min Yan, Zhenggang Zhu, Bingya Liu, Chao Yan, Liping Su,“Cancer-associated fibroblasts impair the cytotoxic function of NK cells in gastric cancer by inducing ferroptosis via iron regulation”,2023,Redox Biology,doi.org/10.1016/j.redox.2023.102923
6、Zixuan Yuan,ORCID,Xiaoming Zhou ,Yan Zou ,Bingtao Zhang ,Yao Jian ,Qi Wu ,Shujuan Chen and Xin Zhang“Hypoxia Aggravates Neuron Ferroptosis in Early Brain Injury Following Subarachnoid Hemorrhage via NCOA4-Meditated Ferritinophagy”,Antioxidants,2023,doi.org/10.3390/antiox12122097
关联产品
DNA损伤定量试剂盒——DNA Damage Quantification Kit -AP Site Counting DK02
氧化应激与自由基
品名货号用途
DNA损伤定量试剂盒——DNA Damage Quantification Kit -AP Site Counting | DK02 | DNA损伤定量检测 |
DPPP试剂 | D350 | 氧化应激检测 |
细胞中的氧化应激是由代谢、电离辐射和与DNA直接相互作用的致癌化合物产生的ROS导致的。在代谢的过程中,小部分的氧由于一个电子的还原变成超氧阴离子,接着超氧阴离子被超氧化物岐化酶 (SOD) 转变成氧气和过氧化氢。过氧化氢由过氧化氢酶或谷胱甘肽过氧化物酶还原成水。然而如果过氧化氢并没有被这些酶完全还原,当它被铁(Fenton反应)氧化将产生反应性极强的羟自由基。羟自由基还可以由紫外线照射产生或直接电离辐射水产生。羟自由基可以与脂反应产生脂质过氧化物。然而并非所有ROS都是有害的。次氯酸盐离子是一种由中性粒细胞的髓过氧化物酶产生的过氧化氢衍生而来的ROS,它具有杀菌活性。NO也称为内皮来源的舒张因子,它是由NO合成酶产生的。不过NO和超氧阴离子反应可产生具有细胞毒性的过氧亚硝基阴离子。ROS和活性氮化合物在生物系统中具有许多不同的活性。相应地好氧生物会产生防止氧化应激的防御机制。最近在对防御机制以及氧化损伤与疾病或老化过程之间关系的研究中,氧化应激已成为许多研究的焦点。最终已发展出许多用于检测ROS相关或ROS来源的物质的方法,这些物质包括超氧阴离子、超氧化物岐化酶、谷胱甘肽、谷胱甘肽还原酶、谷胱甘肽过氧化物酶、DNA损伤、8-氧基鸟嘌呤、8-硝基鸟嘌呤和蛋白质羰基等。
氧化型/还原型谷胱甘肽定量试剂盒-GSSG/GSH Quantification Kit II G263
氧化应激与自由基
品名货号用途
氧化型/还原型谷胱甘肽定量试剂盒-GSSG/GSH Quantification Kit II | G263 | 氧化型/还原型谷胱甘肽定量 |
Total Glutathione Quantification Kit试剂盒 | T419 | 总谷胱甘肽检测 |
DTNB试剂 | D029 | 氧化应激检测 |
2-PDS试剂 | P016 | 总谷胱甘肽GSH检测 |
4-PDS试剂 | P017 | 总谷胱甘肽GSH检测 |
细胞中的氧化应激是由代谢、电离辐射和与DNA直接相互作用的致癌化合物产生的ROS导致的。在代谢的过程中,小部分的氧由于一个电子的还原变成超氧阴离子,接着超氧阴离子被超氧化物岐化酶 (SOD) 转变成氧气和过氧化氢。过氧化氢由过氧化氢酶或谷胱甘肽过氧化物酶还原成水。然而如果过氧化氢并没有被这些酶完全还原,当它被铁(Fenton反应)氧化将产生反应性极强的羟自由基。羟自由基还可以由紫外线照射产生或直接电离辐射水产生。羟自由基可以与脂反应产生脂质过氧化物。然而并非所有ROS都是有害的。次氯酸盐离子是一种由中性粒细胞的髓过氧化物酶产生的过氧化氢衍生而来的ROS,它具有杀菌活性。NO也称为内皮来源的舒张因子,它是由NO合成酶产生的。不过NO和超氧阴离子反应可产生具有细胞毒性的过氧亚硝基阴离子。ROS和活性氮化合物在生物系统中具有许多不同的活性。相应地好氧生物会产生防止氧化应激的防御机制。最近在对防御机制以及氧化损伤与疾病或老化过程之间关系的研究中,氧化应激已成为许多研究的焦点。最终已发展出许多用于检测ROS相关或ROS来源的物质的方法,这些物质包括超氧阴离子、超氧化物岐化酶、谷胱甘肽、谷胱甘肽还原酶、谷胱甘肽过氧化物酶、DNA损伤、8-氧基鸟嘌呤、8-硝基鸟嘌呤和蛋白质羰基等。
Sulfo-AC5-SPDP试剂 S359 IgG纯化分离
蛋白抗体标记
品名货号用途
Sulfo-AC5-SPDP试剂 | S359 | IgG纯化分离 |